La especialización en Manejo y Conservación de los Recursos Naturales se encuentra bajo el área de investigación Economía y Medio Ambiente del doctorado en Ciencias de la Agricultura. Esta especialización aplica conocimientos de restauración ambiental, cambio global, manejo de ecosistemas y conservación biológica.

El doctorado tiene como objetivo general la formación de científicos capaces de responder a la demanda por investigación e innovación científica en áreas que en conjunto soportan la agricultura, las interrelaciones del hombre y su entorno, y contribuyen de manera significativa a lograr el bienestar humano en general. Las dos posibles áreas de investigación son Sistemas de Producción Agropecuaria y Economía y Medio Ambiente.